Grupos potenciadores de los islotes pancreáticos enriquecidas en el tipo de variantes de riesgo asociados a la diabetes 2
Lorenzo Pasquali , Kyle J Gaulton , Santiago A Rodríguez- Seguí, Loris Mularoni , Irene Miguel - Escalada , Ildem Akerman, Juan J Tena, Ignasi Morán , Carlos Gómez- Marín , Martijn van de Bunt , Joan Ponsa - Cobas , Natalia Castro , Takao Nammo , Inês Cebola , Javier García- Hurtado, Miguel Ángel Maestro, François Pattou , Lorenzo Piemonti , Thierry Berney , Anna L Gloyn , Philippe Ravassard , José Luis Gómez Skármeta , Ferenc Müller, Mark I McCarthy y Jorge Ferrer
Nature Genetics (2014 ) doi : 10.1038/ng.2870
Recibido 27 de marzo 2013 Aceptado 12 de diciembre 2013 Publicado en Internet el 12 de enero 2014
La diabetes tipo 2 afecta a más de 300 millones de personas , causando graves complicaciones y muerte prematura , sin embargo, los mecanismos moleculares subyacentes son en gran parte desconocidos . La disfunción de los islotes de páncreas es central en la patogénesis de la diabetes tipo 2 , y por lo tanto la comprensión de los islotes de regulación del genoma podría proporcionar valiosos conocimientos mecánicos . Ahora nos hemos trazado y examinó la función de las redes de cis-regulador de los islotes humanos. Identificamos las secuencias genómicas que están dirigidos por factores de transcripción islote impulsando la actividad de genes específicos de los islotes y muestran que la mayoría de tales secuencias residen en grupos de potenciadores que forman la cromatina dominios tridimensionales físicos. Nos encontramos con que variantes de secuencias asociadas con la diabetes tipo 2 y la glucemia en ayunas se enriquecen en estos potenciadores de los islotes agrupados e identificar variantes rasgo asociado que interrumpen la unión del ADN y potenciador de la actividad de los islotes. Nuestros estudios muestran cómo los factores de transcripción de los islotes interactúan funcionalmente con el epigenoma y proporcionan evidencia sistemática de que la desregulación de los potenciadores de los islotes es relevante para el mecanismos de la diabetes tipo 2 subyacente.
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